Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HACD2Q6Y1H2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms