Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RSBN1Q5VWQ0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms