Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACSM3Q53FZ2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms