Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZNF56Q15929 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms