Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
EEA1Q15075 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EEA1Q15075 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
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