Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDCD11Q14690 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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