Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPN11Q06124 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms