Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NHLH2Q02577 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms