Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DSG1Q02413 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DSG1Q02413 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms