Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB38P57729 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB38P57729 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB38P57729 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB38P57729 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB38P57729 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB38P57729 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB38P57729 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB38P57729 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB38P57729 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms