Protein–RNA interactions for Protein: P50553

ASCL1, Achaete-scute homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL1P50553 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ASCL1P50553 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ASCL1P50553 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms