Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGFBR1P36897 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TGFBR1P36897 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms