Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXC13P31276 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXC13P31276 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms