Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD247P20963 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD247P20963 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CD247P20963 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD247P20963 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms