Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RAB5AP20339 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RAB5AP20339 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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