Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCNA2P20248 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms