Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYBBP04839 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYBBP04839 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYBBP04839 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYBBP04839 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYBBP04839 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYBBP04839 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms