Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CFDP00746 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CFDP00746 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CFDP00746 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CFDP00746 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CFDP00746 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CFDP00746 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CFDP00746 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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