Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GABARAPO95166 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms