Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms