Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSFQ9UBX1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTSFQ9UBX1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms