Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SNX15Q9NRS6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms