Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-216ENST00000530118 561 ntTSL 317.78■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RNF207-205ENST00000484435 551 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.434e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEC22C-206ENST00000420163 553 ntTSL 417.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SEC22C-203ENST00000383750 752 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SMG9-209ENST00000599804 438 ntTSL 217.7■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 L3MBTL1-208ENST00000434666 573 ntTSL 417.67■□□□□ 0.424e-17■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SDHB-203ENST00000466613 828 ntTSL 217.67■□□□□ 0.429e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CENPBD1P1-202ENST00000473164 944 ntTSL 217.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-208ENST00000591489 653 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-203ENST00000627375 731 ntTSL 1 (best)17.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-209ENST00000587540 661 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AHI1-210ENST00000524469 1074 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 AL356599.1-207ENST00000592775 698 ntTSL 417.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SPPL2A-207ENST00000560288 742 ntTSL 217.61■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CCNF-203ENST00000564236 789 ntTSL 317.61■□□□□ 0.419e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 COL6A1-206ENST00000498614 2358 ntTSL 1 (best)17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RGS3-224ENST00000489082 530 ntTSL 417.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 POLRMT-206ENST00000590709 1106 ntTSL 217.52■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PARP14-206ENST00000494811 581 ntTSL 417.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNDC15-205ENST00000506916 517 ntTSL 317.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TXNDC15-210ENST00000511070 1006 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FPGS-205ENST00000423577 677 ntTSL 517.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 IL20RB-202ENST00000469964 1887 ntTSL 217.44■□□□□ 0.389e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARRDC2-209ENST00000608009 576 ntTSL 417.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-210ENST00000562913 875 ntTSL 317.44■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADA-203ENST00000492931 1276 ntTSL 517.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MYO1C-216ENST00000574790 555 ntTSL 417.4■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HPGD-206ENST00000508330 1046 ntTSL 217.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TRIO-218ENST00000512070 8907 ntTSL 217.35■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PLEKHM2-204ENST00000477849 1057 ntTSL 517.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CECR7-201ENST00000414401 546 ntTSL 417.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TRIO-222ENST00000515144 7455 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MYO1F-206ENST00000595325 1132 ntTSL 217.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MUS81-204ENST00000525147 482 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ITGB5-210ENST00000496703 789 ntTSL 217.27■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 RIPK1-203ENST00000479389 1481 ntTSL 317.26■□□□□ 0.359e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.24■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 QARS-249ENST00000637113 1369 ntTSL 517.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DRC3-206ENST00000490517 5805 ntTSL 217.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 GABPB2-205ENST00000486076 833 ntTSL 517.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NSUN5-205ENST00000455763 471 ntTSL 417.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARRDC2-206ENST00000595712 615 ntTSL 417.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 LMBR1L-207ENST00000547698 905 ntTSL 517.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.349e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ITGB5-209ENST00000488466 971 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NPW-203ENST00000567649 398 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-215ENST00000631193 991 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMBS-222ENST00000545621 1282 ntTSL 1 (best)17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMBS-207ENST00000536185 441 ntTSL 317.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 HMBS-225ENST00000546302 707 ntTSL 517.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 E2F6-204ENST00000428221 3139 ntTSL 1 (best)17.02■□□□□ 0.319e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 QARS-214ENST00000478561 670 ntTSL 317.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NBAS-209ENST00000485694 1798 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 BECN1-221ENST00000612631 559 ntTSL 417■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FNDC1-202ENST00000329629 6034 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 PORCN-213ENST00000528612 745 ntTSL 216.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 WDR60-204ENST00000454771 812 ntTSL 416.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MRVI1-206ENST00000529448 2548 ntTSL 216.96■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MRVI1-203ENST00000526414 1650 ntTSL 216.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MXRA8-210ENST00000478517 846 ntTSL 316.93■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 NAXD-203ENST00000470164 2377 ntTSL 216.92■□□□□ 0.34e-8■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 MYO1C-206ENST00000570984 901 ntTSL 516.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 EVC-202ENST00000506240 588 ntTSL 316.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.39e-12■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP17-211ENST00000573449 574 ntTSL 316.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 149.1
UTP3Q9NQZ2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 149.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1316.2 ms