RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496703.1

ITGB5-210, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB5, Length 789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-210ENST00000496703 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.74■■■■□ 3.95
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ITGB5-210ENST00000496703 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.37■■■□□ 2.93
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ITGB5-210ENST00000496703 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.22■■■□□ 2.91
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ITGB5-210ENST00000496703 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.01■■■□□ 2.87
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ITGB5-210ENST00000496703 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.82■■■□□ 2.85
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ITGB5-210ENST00000496703 SCRIBQ14160 1630 aa32.33■■■□□ 2.77
ITGB5-210ENST00000496703 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.18■■■□□ 2.74
ITGB5-210ENST00000496703 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.94■■■□□ 2.7
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ITGB5-210ENST00000496703 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.52■■■□□ 2.64
ITGB5-210ENST00000496703 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.27■■■□□ 2.6
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ITGB5-210ENST00000496703 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.66■■■□□ 2.5
ITGB5-210ENST00000496703 SMARCA2P51531 1590 aa30.65■■■□□ 2.5
ITGB5-210ENST00000496703 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.58■■■□□ 2.49
ITGB5-210ENST00000496703 HMGXB3Q12766 1538 aa30.57■■■□□ 2.48
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ITGB5-210ENST00000496703 WIZO95785 1651 aa30.36■■■□□ 2.45
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ITGB5-210ENST00000496703 ERCC6Q03468 1493 aa29.95■■■□□ 2.39
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ITGB5-210ENST00000496703 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.94■■■□□ 2.38
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ITGB5-210ENST00000496703 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.8■■■□□ 2.36
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ITGB5-210ENST00000496703 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.48■■■□□ 2.31
ITGB5-210ENST00000496703 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.44■■■□□ 2.3
ITGB5-210ENST00000496703 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.43■■■□□ 2.3
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ITGB5-210ENST00000496703 TOPBP1Q92547 1522 aa29.02■■■□□ 2.24
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ITGB5-210ENST00000496703 ABCC8Q09428 1581 aa28.9■■■□□ 2.22
ITGB5-210ENST00000496703 IFT140Q96RY7 1462 aa28.82■■■□□ 2.2
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ITGB5-210ENST00000496703 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
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ITGB5-210ENST00000496703 TOP2BQ02880 1626 aa28.46■■■□□ 2.15
ITGB5-210ENST00000496703 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.15
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ITGB5-210ENST00000496703 CHD1O14646 1710 aa28.4■■■□□ 2.14
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ITGB5-210ENST00000496703 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
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ITGB5-210ENST00000496703 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
ITGB5-210ENST00000496703 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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ITGB5-210ENST00000496703 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.01■■■□□ 2.07
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ITGB5-210ENST00000496703 GRIN2AQ12879 1464 aa27.94■■■□□ 2.06
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ITGB5-210ENST00000496703 CUL7Q14999 1698 aa27.74■■■□□ 2.03
ITGB5-210ENST00000496703 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.69■■■□□ 2.02
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ITGB5-210ENST00000496703 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.6■■■□□ 2.01
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