RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496703.1

ITGB5-210, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB5, Length 789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-210ENST00000496703 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.74■■■■□ 3.95
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ITGB5-210ENST00000496703 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.37■■■□□ 2.93
ITGB5-210ENST00000496703 NACADO15069 1562 aa33.29■■■□□ 2.92
ITGB5-210ENST00000496703 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.22■■■□□ 2.91
ITGB5-210ENST00000496703 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
ITGB5-210ENST00000496703 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.01■■■□□ 2.87
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ITGB5-210ENST00000496703 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.82■■■□□ 2.85
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ITGB5-210ENST00000496703 SCRIBQ14160 1630 aa32.33■■■□□ 2.77
ITGB5-210ENST00000496703 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.18■■■□□ 2.74
ITGB5-210ENST00000496703 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.94■■■□□ 2.7
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ITGB5-210ENST00000496703 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.52■■■□□ 2.64
ITGB5-210ENST00000496703 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.27■■■□□ 2.6
ITGB5-210ENST00000496703 SMARCA4P51532 1647 aa30.9■■■□□ 2.54
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ITGB5-210ENST00000496703 NCAPD3P42695 1498 aa30.72■■■□□ 2.51
ITGB5-210ENST00000496703 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.66■■■□□ 2.5
ITGB5-210ENST00000496703 SMARCA2P51531 1590 aa30.65■■■□□ 2.5
ITGB5-210ENST00000496703 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.58■■■□□ 2.49
ITGB5-210ENST00000496703 HMGXB3Q12766 1538 aa30.57■■■□□ 2.48
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ITGB5-210ENST00000496703 WIZO95785 1651 aa30.36■■■□□ 2.45
ITGB5-210ENST00000496703 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
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ITGB5-210ENST00000496703 ERCC6Q03468 1493 aa29.95■■■□□ 2.39
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ITGB5-210ENST00000496703 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.94■■■□□ 2.38
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ITGB5-210ENST00000496703 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.8■■■□□ 2.36
ITGB5-210ENST00000496703 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
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ITGB5-210ENST00000496703 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.69■■■□□ 2.34
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ITGB5-210ENST00000496703 CFTRP13569 1480 aa29.61■■■□□ 2.33
ITGB5-210ENST00000496703 PRDM2Q13029 1718 aa29.49■■■□□ 2.31
ITGB5-210ENST00000496703 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.48■■■□□ 2.31
ITGB5-210ENST00000496703 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.44■■■□□ 2.3
ITGB5-210ENST00000496703 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.43■■■□□ 2.3
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ITGB5-210ENST00000496703 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
ITGB5-210ENST00000496703 TOPBP1Q92547 1522 aa29.02■■■□□ 2.24
ITGB5-210ENST00000496703 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29■■■□□ 2.23
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ITGB5-210ENST00000496703 ABCC8Q09428 1581 aa28.9■■■□□ 2.22
ITGB5-210ENST00000496703 IFT140Q96RY7 1462 aa28.82■■■□□ 2.2
ITGB5-210ENST00000496703 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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ITGB5-210ENST00000496703 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.67■■■□□ 2.18
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ITGB5-210ENST00000496703 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
ITGB5-210ENST00000496703 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.48■■■□□ 2.15
ITGB5-210ENST00000496703 TOP2BQ02880 1626 aa28.46■■■□□ 2.15
ITGB5-210ENST00000496703 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.45■■■□□ 2.15
ITGB5-210ENST00000496703 OSCARQ8IYS5 282 aa28.41■■■□□ 2.14
ITGB5-210ENST00000496703 CHD1O14646 1710 aa28.4■■■□□ 2.14
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ITGB5-210ENST00000496703 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.3■■■□□ 2.12
ITGB5-210ENST00000496703 GRIN2BQ13224 1484 aa28.27■■■□□ 2.12
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ITGB5-210ENST00000496703 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
ITGB5-210ENST00000496703 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.1■■■□□ 2.09
ITGB5-210ENST00000496703 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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ITGB5-210ENST00000496703 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.01■■■□□ 2.07
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ITGB5-210ENST00000496703 CEP170Q5SW79 1584 aa27.87■■■□□ 2.05
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ITGB5-210ENST00000496703 NUP160Q12769 1436 aa27.83■■■□□ 2.05
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ITGB5-210ENST00000496703 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.75■■■□□ 2.03
ITGB5-210ENST00000496703 CUL7Q14999 1698 aa27.74■■■□□ 2.03
ITGB5-210ENST00000496703 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.69■■■□□ 2.02
ITGB5-210ENST00000496703 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.69■■■□□ 2.02
ITGB5-210ENST00000496703 SHROOM2Q13796 1616 aa27.68■■■□□ 2.02
ITGB5-210ENST00000496703 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.6■■■□□ 2.01
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