Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR35Q9HC97 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR35Q9HC97 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms