Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRIP1Q9BX63 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms