Protein–RNA interactions for Protein: Q96KH6

C18orf12, Uncharacterized protein C18orf12, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf12Q96KH6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C18orf12Q96KH6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C18orf12Q96KH6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms