Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COG3Q96JB2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COG3Q96JB2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms