Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMIGD2Q96BF3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms