Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRIPQ8WXE1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRIPQ8WXE1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRIPQ8WXE1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRIPQ8WXE1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRIPQ8WXE1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRIPQ8WXE1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRIPQ8WXE1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRIPQ8WXE1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms