Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LMO3Q8TAP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMO3Q8TAP4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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