Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC112Q8NEF3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC112Q8NEF3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms