Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms