Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ABRAXAS1Q6UWZ7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms