Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms