Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGAP6Q5VW22 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AGAP6Q5VW22 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms