Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SKOR2Q2VWA4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms