Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACKR1Q16570 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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