Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CARTPTQ16568 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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