Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NTRK3Q16288 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTRK3Q16288 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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