Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PDK3Q15120 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PDK3Q15120 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms