Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LAPTM4AQ15012 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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