Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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