Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
RAB31Q13636 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms