Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1orf61Q13536 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1orf61Q13536 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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