Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMS2P3Q13401 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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