Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMARCB1Q12824 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMARCB1Q12824 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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