Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SCN1BQ07699 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms