Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms