Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TMEM258P61165 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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TMEM258P61165 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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